Родился 19 января 1913 г. в селе Бербеницы Полтавской области в семье крестьянина.
Сначала окончил сельско-хозяйственный техникум и до 1933 года учительствовал на Полтавщине.
С 1933 по 1938 гг. учился на биологическом факультете МГУ и был оставлен в аспирантуре по кафедре физиологии растений.
С началом войны окончил курсы усовершенствования комсостава при Высшей разведшколе. В 1941–1942 гг. воевал на Калининском фронте помощником отделения разведотдела штаба армии, в 1943–1945 гг. сначала на Южном, потом на 4-м Украинском фронте в звании майора. Освобождал Польшу, Чехословакию, Крым.
Был награжден орденом Отечественной войны II степени, орденом Красной звезды, медалями «За отвагу», «За победу над Германией», после войны — Орденом Знак почета.
После демобилизации в 1946 году вернулся на биофак МГУ. Стал кандидатом биологических наук, профессором кафедры физиологии растений. Читал для студентов курс физиологии растений, спецкурс по росту и развитию растений, руководил летней практикой. Научные исследования вел в направлении изучения взаимосвязи между физиологическими функциями корней и надземных органов растений.
Скончался Степан Сидорович Андреенко 9 июня 1988 года.
