Родился 14 апреля 1915 г.
В 1935 г. поступил учиться в МГУ на биологический факультет. В 1941 г. окончил кафедру ихтиологии.
С первых дней Великой Отечественной войны – в рядах действующей армии. В 1941–45 гг. служил штурманом разведывательного авиационного полка в Заполярье. Морские разведчики осуществляли поиск вражеских подводных лодок, сопровождали наши транспортные караваны. Капитан Лебедев В.Д. за доблестное участие в боях с немецко-фашисткими захватчиками был награжден орденом Красного Знамени, орденом Отечественной войны II степени и медалями «За оборону Советского Заполярья», «За победу над Германией».
После окончания войны и демобилизации в 1946 г. В.Д. Лебедев вернулся на кафедру ихтиологии. С 1947 по 1949 гг. работал ст. лаборантом кафедры, а в 1949 г. поступил в аспирантуру. Будучи аспирантом он интенсивно занимался палеоихтиологичесими исследованиями и в 1953 г. блестяще защитил диссертацию на тему «Пресноводная четвертичная ихтиофауна Европейской части СССР», за которую ему была присуждена ученая степень доктора биологических наук. До конца жизни В.Д.Лебедев работал в должности профессора кафедры ихтиологии.
Умер Владимир Дмитриевич Лебедев 6 апреля 1975 года.
