Родился 5 мая 1919 г. в Москве.
К началу Великой Отечественной войны окончил 4 курса по кафедре гидробиологии биофака МГУ.
С августа по октябрь 1941 г. был направлен биофаком МГУ на спецработы в Можайском р-не, затем до мая 1942 г. состоял в команде МПВО МГУ. Воевал на 1-м Украинском фронте, 2-м Белорусском фронте в качестве радиотелеграфиста. Участвовал в освобождении Варшавы и взятии Берлина. Прошел рядовым с боями от Орла до Эльбы.
Награжден орденом Отечественной войны II степени, медалями «За отвагу», «За освобождение Варшавы», «За взятие Берлина», «За победу над Германией » и др.
После демобилизации в 1945 г. вернулся в университет, окончил кафедру ихтиологии в 1947 г.
В 1947–1953 гг. работал на кафедре ст. лаборантом, в 1953–1957 гг. – учился в аспирантуре. С 1965 г. и до конца жизни Юрий Евгеньевич Милановский работал на кафедре ихтиологии старшим инженером рыбоводом, затем старшим научным сотрудником. Интенсивно работал в области разработки биологических основ выращивания рыб в поликультуре, занимался проблемами использования растительноядных рыб в рыбоводстве.
Умер Юрий Евгеньевич Милановский 8 октября 1989 г.
