Родился Юрий Константинович 6 октября (23 сентября) 1914 года в Казани. В школе занимался в кружке юннатов при Казанском зоопарке. В 1934 году сначала поступил в Воронежский университет, а затем перевёлся на Биологический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова, который окончил в 1940 году. Одновременно на военной кафедре университета он получил армейскую специальность командира артиллерийского взвода и звание младшего лейтенанта.
16 августа 1941 года Юрий Константинович был мобилизован в Красную Армию и направлен в Алма-Ату в 44-ый запасный артиллерийский полк. С ноября 1941 года воевал на Юго-Западном фронте в качестве командира взвода управления 155-ого стрелкового полка. В декабре 1941 года был легко ранен, в январе 1942 года получил тяжелое осколочное ранение в область левой лопатки. После лечения в августе 1942 года окончил курсы повышения квалификации в Артиллерийской академии ИМ. Ф.Э. Дзержинского. С ноября 1942 года и до конца войны воевал в составе 615-ого гаубичного полка 44-ой гаубичной бригады. С февраля 1943 года командир дивизиона. Артдивизион под командованием Ю.К. Попова принимал участие в освобождении Орла, в боях под Киевом, освобождении Молдавии, Румынии. В ходе боёв в Польше был ранен в ногу. Победу Юрий Константинович встретил В Праге в должности начальника штаба и в звании майора.
Юрий Константинович награждён пятью боевыми орденами: двумя орденами Боевого Красного Знамени, Двумя орденами Отечественной войны I и II степени и орденом Красной звезды. Шестой орден – Отечественной войны Iстепени – ему вручили в 1985 году к 40-1 годовщине Победы.
После демобилизации в марте 1946 года Юрий Константинович работал зоологом на Зарайской противотуляремийной станции. В 1947 году вернулся в Казань, где устроился старшим научным сотрудников Волжско-Камского отделения ВНИИ охотничьего промысла. В послевоенные годы Ю.К. Попов принимал активное участие в экспедиционных работах лаборатории зоологии Биологического института Казанского филиала АН СССР. В 1951 году защитил кандидатскую диссертацию на тему: «Результаты акклиматизации, Экология и хозяйственное значение енотовидной собаки в Волжско-Камском крае». С 1956 года Ю.К. Попов с семьёй переехал в город Ижевск для работы в качестве преподавателя в Ижевском государственном сельхоз институте. Работал Юрий Константинович доцентом на кафедре микробиологии и зоологии. В 1964 году он перешёл на работу в Удмуртский государственный пединститут, где в должности доцента кафедры зоологии проработал до 1982 года.
Скончался Ю.К. Попов в 2002 году.