Родился в 1909 году в г. Евпатории.
Поступил на биологический факультет 1933 году. В 1934 году начал специализацию по кафедре антропологии. В 1938 году после окончания университета был оставлен в аспирантуре. Научный сотрудник Института антропологии МГУ. Его научные интересы были связаны с проблемами расоведения и этнической антропологии. За несколько месяцев до начала войны он защитил кандидатскую диссертацию.
В июле 1941 года, несмотря на очень плохое зрение, С. Шлугер вступил в ряды народного ополчения.
Погиб в начале 1942 года.